כאשר נמשכים העימותים בין פלגים צבאיים יריבים בסודאן, אלפי אזרחים זרים פונו מהמדינה, ומשפחות מקומיות נמלטו מעיר הבירה, חרטום. למרות הסכם הפסקת האש של 72 שעות שנחתם ביום שישי, עדים דיווחו כי הלחימה נמשכה בסוף השבוע, כולל קרב גדול בשכונת חלפיה בחרטום. הכוחות המזוינים של סודאן וכוחות התמיכה המהירה היו מעורבים בלחימה. בינתיים, תושבים מקומיים דיווחו כי שווקים וחנויות היו ממוקדים על ידי בוזזים מכיוון שאספקת המזון, המים והתרופות אוזלת. המצב גרם לפריסת המשטרה הסודנית בחרטום לראשונה מאז תחילת העימותים, כדי לשמור על אבטחה בתוך הביזה.
חוסר היציבות המתמשך הוביל לפינוי אזרחים זרים מסודן, כולל בריטניה, סין, איחוד האמירויות הערביות וארה"ב. כמה מדינות מפנים את אזרחיהן מאז אמצע יוני, כאשר בריטניה הודיעה ביום שבת כי פינתה למעלה מ-1,888 אנשים ב-21 טיסות מאז החלו פעולות הפינוי ביום שלישי. סין דיווחה כי פינתה בין רביעי לשבת 940 אזרחים סינים ו-231 עובדים זרים מסודן לסעודיה. איחוד האמירויות הערביות מסרה כי היא פינתה אזרחים ואזרחים של 16 מדינות אחרות, כולל קבוצות פגיעות כמו ילדים וקשישים.
למרות פינוי אזרחים זרים, המצב בשטח בסודן נותר חמור. מדיווחים עולה כי מאות בני אדם נהרגו, ואלפים נפצעו מאז תחילת הלחימה. מומחים הזהירו מפני הסיכון לאסון הומניטרי, תוך שהם מציינים מחסור במזון, מים, תרופות וחשמל. המצב אילץ אזרחים מקומיים רבים לברוח מחרטום, כאשר יותר מעשרת אלפים משפחות היגרו לעיר שנדי, 172 ק"מ צפונית לחרטום, בשבועיים האחרונים בלבד. אזרחי שנדי פתחו ביוזמה לעזור למשפחות העקורים, לספק להן דיור חינם, מזון וסיוע רפואי.