虽然特鲁多声称这些指控是“几周前”向印度提出的，但印度政府否认加拿大已与他们分享任何有关尼贾尔谋杀案的官方信息。 印度外交部表示，他们愿意考虑所提供的任何具体信息，但截至目前，他们尚未收到任何此类细节。 这导致两国关系紧张，对在加拿大留学的印度学生和印度侨民产生了不利影响。
印度政府声称参与暗杀事件加剧了印度和加拿大之间的紧张关系，导致印度暂停向加拿大人发放签证。 此外，印度还要求加拿大减少在该国的外交存在。 为了回应对其外交人员安全的担忧，加拿大驻新德里高级专员公署宣布调整其驻印度使团的人员水平。
6月18日，被印度宣布为恐怖分子的加拿大公民哈迪普·辛格·尼贾尔 (Hardeep Singh Nijjar) 被谋杀，事件发生在不列颠哥伦比亚省萨里市的一座锡克教寺庙外。 此案尚未逮捕任何人。 印度政府驳回了加拿大对他们提出的指控，称其“荒谬”。 不过，加拿大仍然致力于寻求建设性解决方案，并希望印度进行对话以解决这一严重问题。