בהסלמה נוספת של הדיכוי שלה נגד אנשי אופוזיציה והכנסייה הקתולית, ממשלת ניקרגואה עצרה בישוף שני, לפי מקורות שמכירים את המצב. הבישוף איזידורו מורה, מכנסיית סיונה בחוף הים הקריבי של המדינה, נעצר על ידי השלטונות לאחר שהשתתף במיסה שחוגגת את יום השנה לכנסיית מטגלפה. המעצר מגיע כאשר ממשל הנשיא דניאל אורטגה ממשיך במאמציה מרחיקי הלכת לדכא התנגדות ולערער את השפעתה של הכנסייה הקתולית בניקרגואה.
פרטים לגבי מעמדו המשפטי של הבישוף מורה ונסיבות מעצרו נותרו לא ברורות מאחר שממשלת ניקרגואה לא סיפקה מידע נוסף בשלב זה. עם זאת, מקור אחד שהיה עד לאירועים שהובילו למעצר חשף כי מורה הזכיר בקצרה את הבישוף העצור ומבקר הממשלה, רולנדו אלווארז, במהלך דרשה של 10 דקות. למרבה הצער, מעצרה של מורה הגיע זמן קצר לאחר מכן, והעלה חששות לגבי הכוונת מנהיגים דתיים המביעים התנגדות נגד הממשלה.
הבישוף אלווארז, מהדיוקסיה של מטגלפה, כבר ריצה עונש מאסר של 26 שנים באשמת קשירת קשר ובגידה. הוא סירב לעזוב את המדינה לצד 200 אחרים שהתנגדו לממשלה, מה שהוביל לגזר דינו. מעצרו של הבישוף מורה, שהתייחס לאלוורז בתפילותיו, מדגיש את התעצמות המאמצים של ממשלת ניקרגואה לחנוק כל אופוזיציה, במיוחד בתוך הכנסייה הקתולית.
מצבו של הבישוף מורה מאז מעצרו עדיין לא ידוע, מה שגורם לחרדה בקרב העוקבים אחר המצב. מקור אחר חשף את השכיחות של רדיפה עזה נגד הכנסייה בניקרגואה, כאשר אנשים רבים העדיפו לשתוק עקב איומים פוטנציאליים ותגובת נגד מצד הממשלה. למרות הסבל שסבלו אנשים אלה, הם מכירים בכך שהקהילה הבינלאומית מודעת למצוקתם.
מאז 2018, כאשר ממשלתו של הנשיא אורטגה דיכאה באלימות הפגנות נגד המשטר, והביאו למקרי מוות, פציעות ומעצרים שרירותיים, עשרות אלפי בני ניקרגואה נמלטו מהמדינה מחשש לרדיפה. הפגנות במהלך אותה תקופה חיפשו לעתים קרובות מקלט בתוך כנסיות וקתדרלות מפני התקפות שבוצעו על ידי כוחות פרו-ממשלתיים. הנשיא אורטגה וסגן הנשיא רוסריו מוריו מזהים את הכנסייה הקתולית ככוחות אופוזיציה ומגנים את ההפגנות כ"ניסיון הפיכה", המחמיר את האנטגוניזם של השלטונות כלפי המוסד הדתי.
מעצרו האחרון של הבישוף מורה בעקבות גירושן של שתי נזירות קוסטה ריקה מניקרגואה באפריל. הם גם היו ממוקדים לאחר שהתפללו עבור הבישוף אלווארז. תקריות אלו הן חלק ממגמת דיכוי רחבה יותר נגד הכנסייה הקתולית במדינה. Yader Morazán, מומחה למערכת המשפט של ניקרגואה, ציין כי עשרות כמרים והדיוטות נכלאו, ויותר מ-200 אנשים, כולל כמרים ונזירות, גורשו או נמנעו מלחזור לניקרגואה.
בנוסף לטקטיקה של הממשלה, מהדורת חדשות לאחרונה מאתר האינטרנט הממשלתי El19digital הודיעה על מעצרם של 11 אנשים הקשורים לארגונים נוצריים באשמת הלבנת הון. פעולות אלו מדגישות את השימוש ההולך וגובר של השלטונות בניקרגואה באמצעים משפטיים כדי לדכא התנגדות ולצמצם את השפעתם של מוסדות דת.
הנשיא אורטגה הבטיח את כהונתו החמישית כנשיא ב-2021. מאז, ממשלו השתמש בחוק ביטחון לאומי מעורפל כעילה לעצור מועמדים, מנהיגים, עיתונאים ופעילי זכויות אדם מהאופוזיציה לקראת הבחירות. הדיכוי המוגבר נגד הכנסייה הקתולית ומנהיגיה ממחיש עוד יותר את נחישותה של הממשלה לדכא כל קול מתנגד ולבסס את כוחה.